現在、中小企業経営相談室のほかに、以下の特別相談室を設置しています。
●道では、消費税率や最低賃金の引き上げ、外国人観光客の減少、また、令和2年4月から中小企業に導入される時間外労働の上限規制などにより、中小企業者等への影響が懸念されることから、中小企業者等の経営及び金融の相談に対応するため、令和元年（2019年）10月1日付けで「経済環境変化に伴う経営・金融特別相談室」を設置しました。
●道では、水産物の不漁により経営に影響を受けている関連中小企業者等からの経営・金融に関する相談に対応するため、「水産物不漁関連中小企業等経営・金融相談室」を設置しております。
●道では、オホーツク管内斜里町で発生した遊覧船事故により影響を受けた中小企業者からの経営及び金融の相談に対応するため、令和4年4月28日付けで「知床観光関連中小企業等経営・金融特別相談室」を設置しました。
●米国の関税引き上げに伴い、今後、関連する中小企業者への影響が懸念されることから、影響を受ける関連中小企業者の経営及び金融の相談に対応するため、令和7年（2025年）4月3日付けで「米国関税関連中小企業経営・金融特別相談室」を設置しました。
●道では、高病原性鳥インフルエンザの発生に伴う関連中小企業者等からの経営及び金融の相談に対応するため、令和7年10月22日付けで「高病原性鳥インフルエンザ関連中小企業等経営・金融相談室」を設置しました。